Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
BRF1Q92994 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRF1Q92994 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRF1Q92994 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRF1Q92994 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRF1Q92994 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRF1Q92994 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRF1Q92994 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRF1Q92994 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRF1Q92994 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRF1Q92994 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRF1Q92994 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRF1Q92994 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRF1Q92994 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms