Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNPO1Q92973 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNPO1Q92973 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNPO1Q92973 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNPO1Q92973 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms