Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCSTNQ92542 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCSTNQ92542 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCSTNQ92542 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCSTNQ92542 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCSTNQ92542 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCSTNQ92542 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms