Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CTTNBP2Q8WZ74 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CTTNBP2Q8WZ74 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CTTNBP2Q8WZ74 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CTTNBP2Q8WZ74 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms