Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PALLDQ8WX93 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PALLDQ8WX93 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PALLDQ8WX93 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PALLDQ8WX93 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms