Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PRUNE2Q8WUY3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRUNE2Q8WUY3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRUNE2Q8WUY3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRUNE2Q8WUY3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRUNE2Q8WUY3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms