Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM87AQ8NBN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM87AQ8NBN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM87AQ8NBN3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMEM87AQ8NBN3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM87AQ8NBN3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM87AQ8NBN3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms