Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAAF3Q8N9W5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAAF3Q8N9W5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAAF3Q8N9W5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms