Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMNTD2Q8IXW0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMNTD2Q8IXW0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNTD2Q8IXW0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms