Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHERPQ8IWX8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHERPQ8IWX8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHERPQ8IWX8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHERPQ8IWX8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms