Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC6Q8IVU3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC6Q8IVU3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC6Q8IVU3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERC6Q8IVU3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HERC6Q8IVU3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms