Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROCCP3Q8IVE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROCCP3Q8IVE0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROCCP3Q8IVE0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCP3Q8IVE0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms