Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DZIP3Q86Y13 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DZIP3Q86Y13 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
DZIP3Q86Y13 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DZIP3Q86Y13 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DZIP3Q86Y13 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
DZIP3Q86Y13 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DZIP3Q86Y13 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DZIP3Q86Y13 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DZIP3Q86Y13 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DZIP3Q86Y13 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms