Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBBP6Q7Z6E9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBBP6Q7Z6E9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RBBP6Q7Z6E9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RBBP6Q7Z6E9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBBP6Q7Z6E9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBBP6Q7Z6E9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms