Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR53Q7Z5U6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR53Q7Z5U6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR53Q7Z5U6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms