Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KRT28Q7Z3Y7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KRT28Q7Z3Y7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KRT28Q7Z3Y7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KRT28Q7Z3Y7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
KRT28Q7Z3Y7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KRT28Q7Z3Y7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms