Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
STRCQ7RTU9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCQ7RTU9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
STRCQ7RTU9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
STRCQ7RTU9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms