Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms