Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP9Q7RTR0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP9Q7RTR0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP9Q7RTR0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP9Q7RTR0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms