Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms