Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q71RC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q71RC1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q71RC1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q71RC1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q71RC1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q71RC1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q71RC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q71RC1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q71RC1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q71RC1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q71RC1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q71RC1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q71RC1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q71RC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q71RC1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q71RC1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q71RC1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q71RC1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q71RC1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q71RC1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q71RC1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q71RC1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q71RC1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q71RC1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q71RC1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q71RC1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q71RC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q71RC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q71RC1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q71RC1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q71RC1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q71RC1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q71RC1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q71RC1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q71RC1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q71RC1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q71RC1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q71RC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q71RC1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q71RC1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q71RC1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q71RC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q71RC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q71RC1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q71RC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q71RC1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q71RC1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q71RC1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q71RC1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q71RC1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q71RC1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q71RC1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q71RC1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q71RC1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q71RC1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q71RC1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q71RC1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q71RC1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q71RC1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q71RC1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q71RC1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q71RC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q71RC1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q71RC1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q71RC1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q71RC1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q71RC1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q71RC1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q71RC1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q71RC1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q71RC1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q71RC1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q71RC1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q71RC1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q71RC1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q71RC1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q71RC1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q71RC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q71RC1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q71RC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q71RC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q71RC1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q71RC1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q71RC1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q71RC1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q71RC1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q71RC1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q71RC1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q71RC1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q71RC1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms