Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00575Q6W349 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00575Q6W349 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00575Q6W349 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms