Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPSL2Q6UWE3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPSL2Q6UWE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPSL2Q6UWE3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLPSL2Q6UWE3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLPSL2Q6UWE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLPSL2Q6UWE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPSL2Q6UWE3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLPSL2Q6UWE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms