Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BRWD3Q6RI45 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BRWD3Q6RI45 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
BRWD3Q6RI45 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRWD3Q6RI45 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BRWD3Q6RI45 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms