Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALNT18Q6P9A2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT18Q6P9A2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT18Q6P9A2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT18Q6P9A2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT18Q6P9A2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms