Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC8EQ6NSJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC8EQ6NSJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms