Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SOGA3Q5TF21 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SOGA3Q5TF21 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SOGA3Q5TF21 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SOGA3Q5TF21 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SOGA3Q5TF21 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms