Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC4Q5GLZ8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HERC4Q5GLZ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC4Q5GLZ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms