Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB6CQ53S08 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB6CQ53S08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB6CQ53S08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB6CQ53S08 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB6CQ53S08 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.4 ms