Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC38Q502W7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC38Q502W7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC38Q502W7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC38Q502W7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC38Q502W7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms