Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMM50Q3ZCQ8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM50Q3ZCQ8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM50Q3ZCQ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIMM50Q3ZCQ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms