Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP5B1Q2VPB7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
AP5B1Q2VPB7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP5B1Q2VPB7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP5B1Q2VPB7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms