Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KLHL40Q2TBA0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KLHL40Q2TBA0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KLHL40Q2TBA0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms