Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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TWIST1Q15672 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TWIST1Q15672 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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TWIST1Q15672 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TWIST1Q15672 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TWIST1Q15672 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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TWIST1Q15672 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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TWIST1Q15672 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TWIST1Q15672 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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TWIST1Q15672 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWIST1Q15672 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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