Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP1Q15431 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP1Q15431 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP1Q15431 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYCP1Q15431 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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