Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR6A1Q15406 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR6A1Q15406 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR6A1Q15406 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NR6A1Q15406 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR6A1Q15406 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms