Protein–RNA interactions for Protein: Q15018

ABRAXAS2, BRISC complex subunit Abraxas 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS2Q15018 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS2Q15018 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS2Q15018 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS2Q15018 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRAXAS2Q15018 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms