Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAT1Q14517 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
FAT1Q14517 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAT1Q14517 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms