Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPRIN1Q14444 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPRIN1Q14444 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPRIN1Q14444 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPRIN1Q14444 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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