Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE6HQ13956 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE6HQ13956 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDE6HQ13956 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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