Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF9Q13886 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF9Q13886 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF9Q13886 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF9Q13886 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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