Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CUL4AQ13619 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CUL4AQ13619 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CUL4AQ13619 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CUL4AQ13619 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CUL4AQ13619 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
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