Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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PTPRSQ13332 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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PTPRSQ13332 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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PTPRSQ13332 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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PTPRSQ13332 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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PTPRSQ13332 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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PTPRSQ13332 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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PTPRSQ13332 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PTPRSQ13332 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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PTPRSQ13332 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
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