Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIGQ13278 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIGQ13278 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIGQ13278 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIGQ13278 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIGQ13278 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIGQ13278 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIGQ13278 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIGQ13278 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIGQ13278 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIGQ13278 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIGQ13278 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIGQ13278 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIGQ13278 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIGQ13278 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RIGQ13278 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIGQ13278 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIGQ13278 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIGQ13278 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIGQ13278 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIGQ13278 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIGQ13278 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIGQ13278 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIGQ13278 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIGQ13278 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIGQ13278 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIGQ13278 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIGQ13278 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RIGQ13278 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RIGQ13278 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIGQ13278 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIGQ13278 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIGQ13278 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RIGQ13278 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIGQ13278 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIGQ13278 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIGQ13278 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIGQ13278 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIGQ13278 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RIGQ13278 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIGQ13278 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIGQ13278 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIGQ13278 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIGQ13278 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIGQ13278 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIGQ13278 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIGQ13278 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIGQ13278 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIGQ13278 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIGQ13278 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIGQ13278 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RIGQ13278 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIGQ13278 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIGQ13278 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIGQ13278 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIGQ13278 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIGQ13278 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIGQ13278 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIGQ13278 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RIGQ13278 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIGQ13278 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIGQ13278 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIGQ13278 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIGQ13278 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIGQ13278 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIGQ13278 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RIGQ13278 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIGQ13278 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIGQ13278 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIGQ13278 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIGQ13278 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIGQ13278 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIGQ13278 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIGQ13278 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIGQ13278 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIGQ13278 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RIGQ13278 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIGQ13278 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIGQ13278 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIGQ13278 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIGQ13278 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIGQ13278 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RIGQ13278 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIGQ13278 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIGQ13278 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIGQ13278 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIGQ13278 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIGQ13278 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIGQ13278 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIGQ13278 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIGQ13278 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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