Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLFN5Q08AF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLFN5Q08AF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLFN5Q08AF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLFN5Q08AF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SLFN5Q08AF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SLFN5Q08AF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SLFN5Q08AF3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms