Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGR3Q06889 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EGR3Q06889 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR3Q06889 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms