Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARID5AQ03989 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID5AQ03989 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARID5AQ03989 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms