Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB2Q03252 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNB2Q03252 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNB2Q03252 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNB2Q03252 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms