Protein–RNA interactions for Protein: Q01432

AMPD3, AMP deaminase 3, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD3Q01432 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AMPD3Q01432 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AMPD3Q01432 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AMPD3Q01432 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPD3Q01432 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
AMPD3Q01432 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AMPD3Q01432 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AMPD3Q01432 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
AMPD3Q01432 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
AMPD3Q01432 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPD3Q01432 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPD3Q01432 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPD3Q01432 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AMPD3Q01432 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms