Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HERVK_113P62684 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HERVK_113P62684 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HERVK_113P62684 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HERVK_113P62684 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms