Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPZ1P61923 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPZ1P61923 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPZ1P61923 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPZ1P61923 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms